Giáo trình Điều hòa gen - Nguyễn Thị Ngọc Yến

Nội dung text: Giáo trình Điều hòa gen - Nguyễn Thị Ngọc Yến

1. ĐIỀU HÒA GEN GV: Nguyễn Thị Ngọc Yến
2. Mục tiêu . Điều hòa gen là gì? . Kiểm soát phiên mã . Kiểm soát cảm ứng âm: lac operon . Kiểm soát ức chế âm: hệ tryptophan . Kiểm soát cảm ứng dương: operon arabinose . Kiểm soát hậu dịch mã
3. Hoạt động gen . Sao chép . Phiên mã . Dịch mã protein
4. Điều hòa gen Điều hoà trao đổi chất, là điều khiển tốc độ của các quá trình sinh hoá bằng cách thay đổi thuận nghịch các chất có bản chất protein tham gia vào các quá trình này, hoặc điều hòa hoạt tính của chúng . Điều hòa sinh tổng hợp protein . Sao chép . Phiên mã . Dịch mã . Điều hoà hoạt tính protein
5. Hoạt động gen
6. Điều hòa sao chép
7. Điều hòa sao chép . 15 locus (Dna) di truyền kiểm soát sao chép . Mỗi locus mã hóa cho 1 protein cần thiết cho quá trình sao chép . DnaA cần cho tổng hợp primer . DnaC cần cho việc gắn primer và tham gia phức hệ kéo dài
8. Điều hòa sao chép SAO CHÉP ADN PROTEIN ĐIỀU HÒA KIỂM SOÁT DƢƠNG KIỂM SOÁT ÂM Sự tích lũy chất hoạt hóa cho Tổng hợp chất kiềm hãm một đến ngƣỡng đủ để khởi động cách giới hạn ngay khi bắt đầu một chu trình sao chép mới chu trình sao chép
9. Một số thuật ngữ Protein - Enzyme Gen cấu mARN trúc Protein cơ cấu PROTEIN ĐIỀU HÒA Gen điều hòa mARN Gắn vào KIỂM SOÁT GEN ĐẶC OPERATOR HIỆU ( kiểm soát sự phiên mã)
10. Một số thuật ngữ Protein điều hòa gồm có . Protein ức chế . = Repressor . Gắn operator ngăn cản phiên mã . Thường gặp trong phản ứng đồng hóa . Protein hoạt hóa . = Activator . Gắn promoter/ enhancer cần thiết cho sự biểu hiện operon (kích thích sự phiên mã gen cấu trúc) . Thường gặp trong phản ứng dị hóa
11. Một số thuật ngữ . Promoter: trình tự khởi động . Operator: trình tự trên ADN để protein điều hòa (thường là protein ức chế) gắn vào . Enhancer: trình tự tăng cường trên ADN để protein hoạt hóa gắn vào. Protein này cũng có thể gắn lên promoter 3' 5' Promoter Operator Gene 1 Gene 2 Gene 3 ARN polymerase Repressor
12. Một số thuật ngữ . Operator có thể nằm cạnh promoter hoặc phủ lên 1 phần hoặc toàn bộ promoter Vi tri khơi đâu tông hơp mARN 3' Vùng-35 Vùng-10 5’ TTGACA TTTTACCTCTGGCGGT TATAAT GGTTGC ATGTA (hôp Pribnow) Promoter mARN Operator
13. Một số thuật ngữ . 1 gen cấu trúc (1 nhóm gen) đứng sau trình tự promoter. ARN pol nhận diện promoter sẽ phiên mã sợi có nghĩa thành mARN . Operon: đơn vị phiên mã gồm >= 1 promoter, các gen mã hóa mARN, >= 1 operator . Operon vi khuẩn . Operon nhân thật
14. Operon TB nhân nguyên thủy
15. Điều hòa phiên mã . Hoạt động phiên mã của gen có thể không được điều hòa nếu sản phẩm của chúng không liên quan tới điều kiện môi trường: những sản phẩm không phụ thuộc vào môi trường như vậy được tổng hợp liên tục . Số lượng của những sản phẩm "không được điều hòa" vẫn có thể thay đổi phụ thuộc vào ái lực tương đối của ARN polymerase với promoter. Các promoter có ái lực cao sẽ tạo nhiều sản phẩm của gen hơn là có ái lực thấp
16. Điều hòa phiên mã . Điều hòa âm: gen bị điều hòa bởi pro ức chế (repressor) . Điều hòa dương: gen bị điều hòa bởi pro hoạt hóa (activator)
17. Điều hòa phiên mã . Chất “mở” gen, làm cho gen phiên mã được: chất cảm ứng . Chất “đóng” sự phiên mã: chất ức chế Có 4 loại điều hòa cơ bản: . Cảm ứng âm . Ức chế âm . Cảm ứng dương . Ức chế dương
18. Điều hòa phiên mã . Cảm ứng âm (giải ức chế): Repressor đang cản trở phiên mã. Chất cảm ứng sẽ bất hoạt repressor, thúc đẩy phiên mã . Ức chế âm: gen đang phiên mã. Chất ức chế hoạt hóa repressor phức hợp đồng ức chế ngăn cản phiên mã . Cảm ứng dương: gen không phiên mã. Chất cảm ứng hoạt hóa activator phức hợp hoạt hóa thúc đẩy phiên mã . Ức chế dương: Activator gắn vào gen phiên mã. Chất ức chế bất hoạt activator cản trở phiên mã
19. Cảm ứng âm – lac operon . Thường gặp trong phản ứng đồng hóa . Operon bị kiểm soát bởi protein ức chế được cảm ứng để giải ức chế Cảm ứng âm Chất cảm ứng Gen bị điều hòa bởi repressor (âm) Chất mở gen + Gen đang bị đóng Giải ức chế
20. Cảm ứng âm – lac operon "Hệ lactose" hoang dại: . Gen điều hoà (I+): repressor . “Lac” operon . Promoter (P+) . Operator (O+) . 3 gen cấu trúc: β – galatosidase (Z+), permease (Y+) và transacetylase (A+)
21. Cảm ứng âm – lac operon
22. Cảm ứng âm – lac operon . β-galactosidase . Phân giải lactose thành glucose và galactose . Biến đổi liên kết 1-4 glycosid trong đường lactose thành liên kết 1-6 trong đường allolactose: chất cảm ứng hệ lac operon Khi lactose thiếu hụt trong môi trường thì enzym này không nhiều lắm. Ngay sau khi thêm lactose vào môi trường, nhưng không có glucose, enzym này lập tức được sản sinh . Permease: vận chuyển lactose qua màng vào tb . Transacetylase: chưa rõ
23. Cảm ứng âm – lac operon . Gen điều hòa thường xuyên tạo ra protein điều hòa . Khi thiếu lactose, repressor gắn operon làm ARN pol không gắn vào promoter nên không phiên mã . Khi có lactose, không có glucose: một vài phân tử lactose được permease chuyển qua màng, bị β- galactosidase chuyển thành allolactose. . Allolactose gắn vào repressor gây biến hình dị lập thể, rời ADN. ARN pol bám vào phiên mã . Protein ức chế có 2 tâm đặc thù: (1) gắn với operator và (2) gắn chất cảm ứng
24. Cảm ứng âm – lac operon . Không có lactose
25. Cảm ứng âm – lac operon . Khi có lactose, không có glucose: chất cảm ứng gắn repressor biến hình dị lập thể, bất hoạt repressor
26. Cảm ứng âm – lac operon 3' 5' Promoter Operator Gene 1 Gene 2 Gene 3 ARN polymerase Repressor Sư phiên ma bi phong bê 3' 5' Promoter Operator Gene 1 Gene 2 Gene 3 ARN polymerase Inducer Repressor mARN mARN mARN (a) protein ức chế gắn vào operator và phong bế sự hoạt động của ARN polymerase; (b) chất cảm ứng gắn vào protein ức chế và bất hoạt nó. ARN polymerase tiến hành phiên mã các gen 1,2,3 trong operon
27. Ức chế âm – hệ tryptophan . Sự tổng hợp enzym bị ức chế bởi chính bản thân sản phẩm mà nó xúc tác . Thường xảy ra đối với phản ứng đồng hóa Ức chế âm Chất ức chế Gen điều hòa bởi repressor không hoạt tính (âm) Chất đồng ức chế + Ức chế gốc Phức hợp ức chế chức năng
28. Ức chế âm – hệ tryptophan Hệ tryptophan: . Gen điều hòa: repressor (chất ức chế gốc) tạo ra liên tục nhưng không gắn được operator, cần 1 chất đồng ức chế mới hoạt động được . Operon tryptophan: . Promoter . Operator . 5 gen cấu trúc mã hóa 5 enzym tham gia quá trình tổng hợp tryptophan
29. Ức chế âm – hệ tryptophan Repressor không hoạt tính Enzym tổng hợp tryptophan
30. Ức chế âm – hệ tryptophan . Promoter và operator phủ lên nhau . Khi nồng độ tryptophan tăng lên: Tryptophan (chất đồng ức chế = Co-repressor) + repressor (ức chế gốc không hoạt tính) = Phức hợp ức chế chức năng gắn operator ức chế phiên mã . Khi tryptophan giảm: tryp tách khỏi repressor, repressor rời operator, ARN pol bám vào phiên mã
31. Ức chế âm – hệ tryptophan . Không có tryptophan
32. Ức chế âm – hệ tryptophan . Khi có tryptophan
33. Điều hòa suy giảm - Tryptophan Trình tự dẫn đóng vai trò bộ suy giảm. Theo sau là operon mã hóa enzym tổng hợp protein Phân mã hóa 7-uracyl 3' A XX B C D Tryp operon Ma hoa cho vi tri găn ribosom Vi tri tam ngưng phiên ma Bô suy Trinh tư giam kêt thuc Trinh tư dân Sắp xếp các vùng nucleotid trong trình tự dẫn
34. Điều hòa suy giảm - Tryptophan . Trong điều kiện thừa tryptophan thì ribosom dịch mã ra sợi peptid dẫn, do đó vùng B và C của mARN không tạo nút được. Nhờ đó, vùng C và D bắt cặp được với nhau tạo thành nút kẹp tóc, phong bế ARN polymerase. Khi đó Tryptophan operon không hoạt động . Nếu môi trường thiếu tryptophan thì ribosom sẽ dừng lại ở các codon tryptophan của vùng A. Vì ribosom phủ lên A, nên B bắt cặp với C, do vậy C không thể bắt cặp với D nên không hình thành được kẹp tóc ngừng. Nhờ đó, ARN polymerase tiếp tục phiên mã các gen cấu trúc của tryptophan operon tạo nên mARN tổng hợp các enzym cho tryptophan
35. Điều hòa suy giảm - Tryptophan nma? phie? 5 ùng ? H? 5 ’ (b) (a) ADN ’ Trình t? d?n ADN 7u C Gene caáu truùc ARN polymerase B tryptophan 5 D C A B mARN’ 5 A D ’ mARN 3 Hương dich ma ’ Phiên ma ngưng 3 ’ Mô hình phiên mã suy giảm của operon tryptophan E. coli (a)Thừa tryptophan: ngừng; (b)Thiếu tryptophan: không ngừng
36. Cảm ứng dƣơng - arabinose Hệ arabinose: mã hóa các enzym tham gia chuyển hóa đường arabinose . Gen điều hòa araC: repressor . Operon . Promoter (araI): có thể được hoạt hóa nhờ cAMP qua trung gian CAP/ CRP, ARN pol gắn vào được . Operator (araO) . 3 gen cấu trúc cần cho sự chuyển hóa (dị hóa) đường arabinose (araB, araA, araD) viết tắt BAD araC Promoter araB araA araD
37. Cảm ứng dƣơng - arabinose . Điều hòa âm tính và dương tính . Cơ chất: arabinose là chất cảm ứng của Ara operon . Môi trường thiếu arabinose điều hòa âm tính: repressor bám vào araO làm ADN có dạng loop nên ARN pol không bám vào được . Môi trường thừa arabinose điều hòa dương tính: arabinose bám vào repressor thành “phức hợp hoạt hóa” rời araO, bám vào araI khởi động phiên mã
38. Cảm ứng dƣơng - arabinose . Không có arabinose: Repressor gắn operator làm ADN ở dạng loop ARN pol ko gắn vào được để phiên mã các enzym dị hóa arabinose chỉ có 1 lượng nhỏ
39. Cảm ứng dƣơng - arabinose . Khi có arabinose, không có glucose: Arabinose + repressor = activator (phức hợp hoạt hóa ) rời khỏi operator ARN pol gắn promoter phiên mã
40. Cảm ứng dƣơng - arabinose Promoter: có thể được hoạt hóa nhờ cAMP qua trung gian CAP/ CRP, ARN pol gắn vào được ARN polymerase ARN polymerase AMP + CAP AMP + CAP Promoter Promoter Promoter
41. Đa kiểm soát Một locus di truyền có thể được kiểm soát bởi nhiều cơ chế khác nhau: Khi có glucose, không cần phân giải đường khác gen mã hóa các enzym phân giải đường khác bị đóng lại . Ví dụ: . Không glucose, có lactose: lac operon được cảm ứng . Khi có glucose: lac operon bị đóng Hiệu ứng glucose hay Ức chế dị hóa. . Phức hệ 2 chất hoạt hóa hệ này là cAMP và CAP. Glucose tăng: cAMP giảm, operon không được hoạt hóa và ngược lại.
42. Đa kiểm soát . Với lac operon: có vị trí gắn phức hệ cAMP-CAP. ARN pol chỉ gắn có hiệu quả vào promoter nếu phức hợp cAMP-CAP cũng được gắn vào vị trí này. cAMP không gắn được promoter mà cần liên kết CAP điều hòa cảm ứng dương tính . Khi mức glucose tăng lên trong tế bào, thì lượng cAMP giảm xuống và sẽ có ít phức hệ cAMP-CAP hơn có thể dùng để hoạt hóa lac operon ARN polymerase AMP + CAP Promoter
43. Kiểm soát hậu dịch mã . Sự biểu hiện gen được điều hoà sau khi protein hình thành . Sự kìm hãm ngược: sự ức chế bởi sản phẩm cuối Sản phẩm cuối liên kết với enzym đầu tiên phong bế vị trí xúc tác của enzym ngăn sản xuất quá độ sản phẩm cuối . Sản phẩm cuối liên kết vị trí gần chất kìm hãm (vị trí điều hòa) của enzym làm biến hình dị lập thể enzym
44. 1 = threonin 2 = -ketobutyrate e1 = threonin deaminase Sư dư thưa gây kim ham ngươc e2 g1 g2 Tê bao sư dung isoleucine 3 g5 g3 e5 e3 g4 5 4 e4 Sơ đồ kìm hãm ngƣợc trong E. coli (e = enzym; g = gen; 1,2,3,4,5 = các chất trung gian) isoleucin có nồng độ cao sẽ ức chế enzym e1 (threonin deaminase) kìm hãm toàn bộ con đường tổng hợp isoleucin
45. Tóm tắt Kiểm soát phiên mã . Kiểm soát dương, âm . Cảm ứng, ức chế Ví dụ về kiểm soát phiên mã . Lac operon . Tryptophan operon . Arabinose operon Kiểm soát hậu dịch mã
46. Trang web cập nhật điểm các học phần do bộ môn Vi – ký sinh – khoa Dược chịu trách nhiệm: